尿道结石的形成与多种因素相关。一般来说，尿道结石的形成主要与尿道的局部因素、尿液成分异常以及代谢性因素等有关。
一、尿道局部因素
尿道狭窄： 当尿道存在狭窄情况时，尿液排出不畅，尿液中的晶体物质等就容易在局部沉积，进而形成结石。比如先天性尿道狭窄，从出生时尿道就比正常情况狭窄，尿液通过受阻，长期下来就增加了尿道结石形成的风险。尿道憩室： 尿道憩室是尿道周围与尿道相通的囊性腔隙，尿液容易在憩室内潴留，使得晶体物质等沉积，逐渐形成结石。而且憩室内的环境适合结石物质聚集，一旦有合适的条件就会诱发结石形成。
二、尿液成分异常
尿液中晶体物质过饱和： 当尿液中钙、草酸、尿酸、胱氨酸等晶体物质含量过高，超过了尿液的溶解度，就容易析出形成晶体，进而逐渐形成结石。例如，尿液中钙含量过高时，就可能导致草酸钙等晶体沉积，长期积累可能形成尿道结石。尿液pH值改变： 尿液的酸碱度对结石的形成有影响。不同的晶体物质在不同pH值的尿液中溶解度不同。比如尿酸结石在酸性尿液中容易形成，而磷酸镁铵结石则在碱性尿液中更易形成。如果尿液pH值发生异常改变，就可能促进结石的形成。
三、代谢性因素
甲状旁腺功能亢进： 甲状旁腺功能亢进会使体内甲状旁腺激素分泌增多，导致血钙升高，尿钙排出增加，从而使尿液中钙的含量升高，增加了尿道结石形成的可能性。据研究，甲状旁腺功能亢进患者发生尿道结石的概率比正常人要高很多。痛风患者： 痛风患者体内尿酸代谢紊乱，血尿酸升高，尿尿酸排出增多，容易形成尿酸结石。痛风患者如果不注意控制血尿酸水平，就容易在尿道等部位形成结石。