做完无痛胃镜后一般副作用较少且轻微，多数人在短时间内可恢复。通常来说，无痛胃镜检查后可能出现的副作用主要有以下几方面情况：
术后身体反应方面
咽喉不适： 由于检查时需将胃镜通过咽喉部位，检查后部分人会感觉咽喉部有轻微的疼痛或异物感，一般1~2天可自行缓解。这是因为胃镜通过时对咽喉部黏膜有一定的刺激。头晕乏力： 无痛胃镜是通过静脉注射麻醉药物来实现无痛的，检查后短时间内可能会有头晕、乏力的感觉，一般经过休息，1~2小时后可逐渐减轻并消失。这是因为麻醉药物在体内代谢需要一定时间，代谢过程中可能会让人体有短暂的不适。
检查后饮食注意方面
短时间吞咽食物需谨慎： 检查后咽喉部可能有不适感，所以在检查后的1~2小时内，应避免立即进食过热、过烫或刺激性较强的食物，以免加重咽喉部的不适。可以先选择一些温凉、清淡、易消化的流食或半流食，如米粥、藕粉等。饮食恢复时间： 一般来说，检查后24小时内饮食要以清淡为主，之后可逐步恢复正常饮食，但仍要注意避免食用辛辣、油腻、难以消化的食物，让胃肠道有一个适应的过程。
麻醉药物相关影响方面
药物代谢个体差异： 不同人对麻醉药物的代谢速度不一样，有些人可能代谢相对较慢，头晕乏力等症状持续时间可能会稍长一些，但大多也不会超过24小时。如果超过24小时仍有明显的头晕、乏力等不适，应及时告知医生。药物过敏风险（罕见）： 虽然无痛胃镜使用的麻醉药物过敏反应发生率很低，但极少数人可能对麻醉药物过敏，会出现皮疹、呼吸困难等严重过敏症状，不过这种情况非常罕见，一旦出现需立即进行抢救处理。