双肾结石的治疗方式需根据结石大小、症状等情况而定。一般来说，直径小于0.6厘米的结石，有自行排出的可能，可通过保守治疗等方式处理；而较大的结石可能需要手术等干预。
保守治疗适用情况
小结石观察： 当肾结石直径小于0.6厘米时，可先进行观察。患者要增加饮水量，每天保证尿量在2000毫升以上，这样有助于小结石随尿液排出。比如每天多喝白开水，让尿液不断冲刷尿路，促进结石排出。饮食调整： 要限制高草酸、高嘌呤食物摄入。像菠菜、巧克力、动物内脏、海鲜等要少吃。因为高草酸食物会加重结石形成，高嘌呤食物也不利于肾结石控制。例如，尽量减少菠菜炒鸡蛋这类菜肴的食用。
药物辅助排石
排石药物： 可以使用一些促进结石排出的药物，如α受体阻滞剂等。这类药物能松弛输尿管平滑肌，帮助结石排出。但药物使用要在医生指导下进行，因为不同情况用药有差异。
手术治疗情况
体外冲击波碎石： 如果结石直径在0.6 - 2厘米左右，可考虑体外冲击波碎石。它是利用冲击波聚焦后击碎结石，让结石变成小颗粒，然后随尿液排出。一般一次体外冲击波碎石后，需要观察结石排出情况，可能需要多次治疗。输尿管镜取石或经皮肾镜取石： 对于直径大于2厘米的结石，或者经过其他治疗效果不佳的结石，可能需要进行输尿管镜取石或经皮肾镜取石手术。输尿管镜取石是通过尿道、输尿管进入肾脏，找到结石后取出；经皮肾镜取石则是通过腰部穿刺建立通道进入肾脏取石。手术有一定创伤，但能有效取出较大的结石。