二妙丸和二妙散的主要区别在于制剂不同，但其药物组成功用是相同的。
一、二妙丸，这是一种中成药，由炒苍术、炒黄柏所组成。其具备燥湿清热的功效，主要适用于湿热下注的情况，比如白带异常、阴囊湿痒等。
二、二妙散，属于中医方剂，源自《丹溪心法》，是祛湿剂，具有清热燥湿的作用。主要针对湿热下注证，具体症状表现为筋骨疼痛，或者两脚痿软，或者足膝红肿疼痛，或是湿热带下，或是下部湿疮、湿疹，以及小便短赤，舌苔黄腻等。在临床上常用于治疗风湿性关节炎、阴囊湿疹、阴道炎等属于湿热下注的病症。
总之，二妙丸和二妙散虽制剂有别，但在药物组成和功效方面是一致的，都可用于湿热相关病症的治疗。