胎儿停育的原因较为复杂，约50% - 60%的胎儿停育与胚胎染色体异常有关。
一、胚胎因素
染色体异常： 无论是数目异常还是结构异常都可能导致胎儿停育。比如常见的三体综合征，如13 - 三体、18 - 三体、21 - 三体等，染色体的数目发生了改变，使得胚胎无法正常发育。基因突变： 某些特定基因的突变也会影响胚胎的正常生长，导致胎儿停育发生。
二、母体因素
内分泌失调： 女性体内的激素水平对维持妊娠至关重要。例如，黄体功能不全时，孕酮分泌不足，无法为胚胎着床和发育提供良好的内分泌环境，容易引起胎儿停育。据统计，约有20% - 30%的胎儿停育与黄体功能不全有关。全身性疾病： 孕妇患有严重的全身性疾病，如严重的糖尿病未控制好、高血压、心脏病心功能不全等，会影响胎盘的血液供应，从而影响胎儿的生长发育，导致胎儿停育。免疫异常： 自身免疫性疾病可能会攻击胚胎，例如系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，体内的自身抗体可能会破坏胎盘组织，影响胚胎的着床和发育，引发胎儿停育。
三、父亲因素
精子染色体异常： 男性精子的染色体如果存在异常，如染色体数目异常或结构异常，当与卵子结合形成胚胎后，也可能导致胚胎发育异常，最终引起胎儿停育。
四、环境因素
化学物质接触： 孕妇长时间接触一些有毒的化学物质，像苯、甲醛等，这些化学物质可能会损害胚胎的细胞，干扰胚胎的正常发育过程，增加胎儿停育的风险。辐射暴露： 过量的辐射照射，如孕妇接受了大剂量的X线检查等，辐射会对胚胎的细胞造成损伤，影响胚胎的正常生长，导致胎儿停育发生。