新冠性肺炎后遗症较为复杂，部分患者在感染新冠病毒康复后的3个月甚至更长时间内仍可能存在一些不适症状。例如，约有10%-30%的长期新冠患者会出现疲劳感，这种疲劳感可能会持续数月。
呼吸系统方面的后遗症
咳嗽： 部分患者康复后会遗留较长时间的咳嗽症状，可能会持续数周甚至数月，咳嗽程度有轻有重，有的为刺激性干咳，有的伴有少量白痰。呼吸困难： 少数重症新冠患者康复后可能存在不同程度的呼吸困难，在活动后更为明显，比如爬几层楼梯就会感觉气促明显，这是因为肺部在感染新冠病毒后受到损伤，影响了气体交换功能。
神经系统方面的后遗症
头痛： 一些患者康复后会反复出现头痛，疼痛程度和性质因人而异，有的是胀痛，有的是刺痛。记忆力减退与注意力不集中： 部分患者会感觉自己记忆力不如从前，比如经常忘记刚刚发生的事情，在工作或学习时难以集中注意力，影响正常的生活和工作效率。
心血管系统方面的后遗症
心悸： 康复后的患者可能会偶尔出现心悸症状，感觉心脏跳动不规律、过快或过慢。胸闷： 有的患者会有胸部发闷的感觉，尤其是在情绪波动或活动后，这种胸闷感可能会加重。
其他方面的后遗症
肌肉关节疼痛： 不少患者会出现肌肉酸痛、关节疼痛的情况，疼痛部位不固定，可能累及全身多处肌肉和关节，影响肢体的活动。情绪和心理问题： 部分患者康复后会出现焦虑、抑郁等情绪问题，比如经常感到心情低落、对事物缺乏兴趣，或者容易紧张、担忧，这可能与患病期间的身体不适、对疾病的担忧等多种因素有关。