脑血栓主要是由于脑部血管内形成血栓，阻塞血管，导致局部脑组织缺血缺氧坏死引起的。据统计，我国每年有较多人会发生脑血栓相关病症。
血管自身因素导致
血管粥样硬化：这是很常见的原因。随着年龄增长，血管壁会逐渐出现粥样硬化，血管内膜变得不光滑，脂质等物质容易沉积，使得血管腔变窄，血液流动受阻，为血栓形成创造条件。一般40岁以上人群血管粥样硬化的发生率会逐渐升高。血管炎：某些自身免疫性疾病等可能引发血管炎，炎症会损伤血管内皮，影响血液正常流动，增加血栓形成几率。比如白塞病等疾病可能伴有血管炎表现。
血液成分变化相关
血液黏稠度增高：当人体脱水、患有某些血液系统疾病时，血液黏稠度会升高。例如严重腹泻、呕吐导致身体缺水时，血液中红细胞等有形成分相对比例增加，血液就会变黏稠，血流速度减慢，容易形成血栓。还有真性红细胞增多症患者，血液中红细胞数目异常增多，血液黏稠度显著增高。凝血机制异常：如果体内凝血因子异常增多，或者抗凝血因子减少，就会打破正常的凝血平衡。像遗传性易栓症患者，存在凝血相关基因缺陷，凝血机制容易出现异常，更易形成血栓。
血流动力学因素影响
血流缓慢：长期卧床的病人，血流速度会明显减慢。因为活动减少，肌肉收缩对血管内血液的推动作用减弱，血液在血管内停留时间延长，就容易形成血栓。还有一些心脏功能不全的患者，心输出量减少，也会导致全身血流速度减慢。血压波动：血压突然大幅波动也可能引发脑血栓。比如血压突然降低时，脑部血流灌注不足，血管内血流速度减慢，血液中的有形成分容易沉积形成血栓；而血压突然升高时，可能会损伤血管内皮，促使血栓形成。例如高血压患者血压控制不佳，忽高忽低时，发生脑血栓的风险会增加。