手腕腱鞘囊肿可以通过多种方式处理，一般较小的囊肿有一定自行消退的可能，比如部分患者的囊肿在数月内可能自然消失。
观察等待
无症状小囊肿：如果手腕的腱鞘囊肿较小，没有引起疼痛等不适症状，可先观察，定期留意囊肿变化。有些小的囊肿可能会自行吸收消退。定期复查：要定期观察囊肿的大小、有无疼痛等情况变化，如果囊肿没有变化或者一直较小且无症状，可以继续观察。
非手术治疗方法
挤压法：医生可能会通过外力挤压，使囊肿破裂，让其内容物被周围组织吸收。但这种方法有一定复发几率，不过对于一些较小的囊肿尝试挤压有一定效果。穿刺抽吸：用注射器将囊肿内的液体抽出，然后可能会注射一些药物，如糖皮质激素等，来促进恢复。不过穿刺后也存在复发的可能，而且操作需要在无菌等规范条件下进行。
手术治疗情况
囊肿较大或反复发作：如果手腕腱鞘囊肿较大，影响手腕的活动，或者经过多次保守治疗复发，这时候可能需要考虑手术治疗。手术是将囊肿完整切除，相对来说复发几率会低一些，但手术也有一定的风险，比如感染等情况。手术注意事项：手术前要做好相关检查，手术后要注意伤口护理，按照医生要求进行康复等，一般术后需要一段时间恢复，并且要注意避免手腕过度劳累等情况，防止囊肿再次形成。