卵巢畸胎瘤的治疗主要以手术为主，一旦确诊，通常建议尽早手术切除。对于直径小于5厘米的卵巢畸胎瘤，可定期复查，观察肿瘤变化，约1/4的成熟性畸胎瘤可能会发生恶变，尤其是绝经后女性，恶变风险相对更高。
手术治疗方式
腹腔镜手术：这是较为常用的微创方式，通过在腹部打几个小孔，插入腹腔镜和手术器械进行肿瘤切除。这种手术创伤小，术后恢复快，一般住院3~5天左右就能出院，腹部的疤痕也比较小。开腹手术：适用于肿瘤较大、怀疑有恶性病变或者腹腔镜手术难以完成的情况。开腹手术切口相对较大，一般在10~20厘米左右，术后恢复时间较长，住院时间可能在7~10天。
特殊情况的处理
绝经后女性：绝经后的女性发现卵巢畸胎瘤，由于恶变风险增加，更倾向于积极手术治疗。因为绝经后体内激素水平变化，肿瘤恶变的可能性相对年轻女性更高，所以一旦发现应尽早评估手术。妊娠期卵巢畸胎瘤：妊娠期发现卵巢畸胎瘤，如果肿瘤较小且没有引起不适，可在妊娠中期相对安全的时期进行手术；如果肿瘤较大，可能会影响妊娠或出现扭转等紧急情况，则需要及时手术。手术时要尽量减少对子宫的刺激，以保障胎儿的安全。
非手术治疗的情况
随访观察：对于直径小于5厘米的单纯性成熟性卵巢畸胎瘤，且没有任何症状的年轻患者，可以选择定期复查B超，观察肿瘤大小变化。一般建议3~6个月复查一次B超，连续观察1~2年，如果肿瘤没有增大或有缩小趋势，可继续观察。但如果肿瘤有增大迹象，则需要考虑手术。恶性畸胎瘤的辅助治疗：如果是恶性卵巢畸胎瘤，手术切除后通常还需要进行辅助化疗。化疗方案会根据肿瘤的病理类型、分期等因素来制定，一般需要进行4~6个周期的化疗，通过化疗来杀灭残留的癌细胞，降低复发风险。