肾结石的形成与多种因素有关。一般来说，尿液中某些物质浓度过高，超过了尿液的溶解限度，就容易析出结晶，逐渐形成肾结石。比如尿液中钙、草酸、尿酸等成分异常增多时，就可能引发肾结石。
尿液成分异常相关
草酸摄入过多： 如果日常摄入富含草酸的食物过多，像菠菜、巧克力、浓茶等，就会使尿液中草酸含量升高。正常情况下，人体能处理一定量的草酸，但当摄入过量时，尿液里草酸浓度过高，就容易与钙结合形成草酸钙结晶，长期积累可能发展成肾结石。据统计，约60%的肾结石患者与草酸摄入过多有关。尿酸代谢异常： 体内尿酸生成过多或者排泄减少，都会导致血尿酸升高。尿酸经肾脏过滤进入尿液后，若尿液中尿酸浓度过高，就会形成尿酸结晶，进而可能形成尿酸结石。一些喜欢吃高嘌呤食物（如动物内脏、海鲜）的人，就更容易出现尿酸代谢异常，增加肾结石风险。
尿液酸碱度影响
酸性尿易形成尿酸结石： 当尿液呈酸性时，尿酸盐容易析出形成结晶。比如患有痛风的人，由于体内尿酸代谢紊乱，尿液酸性较强，就比较容易长尿酸结石。碱性尿易形成磷酸钙结石： 而当尿液呈碱性时，磷酸钙等物质容易沉淀形成结晶。像尿路感染患者，由于细菌分解尿素产生氨，使尿液变碱，就可能促进磷酸钙结石的形成。
尿路梗阻等因素
尿路梗阻： 如果存在尿路狭窄、前列腺增生等情况，会导致尿液排出不畅。尿液在肾脏内停留时间过长，其中的结晶物质就更容易沉积下来，逐渐形成结石。比如有前列腺增生的中老年男性，就比其他人更易发生尿路梗阻相关的肾结石。感染因素： 泌尿系统感染时，细菌、脓块等会作为核心，促使矿物质在其周围沉积形成结石。而且感染还会改变尿液的酸碱度，进一步促进结石形成。例如肾盂肾炎患者，发生肾结石的概率就比正常人高不少。