肺栓塞主要通过药物治疗、手术治疗以及其他辅助治疗等方法来处理。一般来说，药物治疗是基础手段之一。
药物治疗方案
抗凝药物： 普通肝素是常用的抗凝药物之一，通过增强抗凝血酶Ⅲ的活性发挥作用，能阻止血栓进一步扩大。低分子肝素也是常见的抗凝药，比如达肝素钠，它的抗凝效果相对稳定，皮下注射即可，不需要频繁监测凝血功能。溶栓药物： 尿激酶是常用的溶栓药，可激活纤溶酶原成为纤溶酶，溶解血栓。重组组织型纤溶酶原激活剂（rt-PA）也是常用溶栓药物，能选择性地激活血栓中的纤溶酶原，快速溶解血栓，但使用时需严格掌握适应证和禁忌证。
手术治疗方式
肺动脉血栓摘除术： 这是一种较为激进的手术方式，适用于病情非常严重、右心功能不全且有大面积肺栓塞的患者。不过，该手术风险较高，需要在具备良好条件的医院，由经验丰富的医生操作。经皮导管介入治疗： 包括导管碎解和抽吸血栓、导管溶栓等。导管碎解和抽吸血栓适用于近端大块肺栓塞、心肺功能不稳定的患者，通过导管将血栓破碎并抽吸出来。导管溶栓则是通过导管直接将溶栓药物注入血栓部位，溶解血栓，相对溶栓药物全身用药，能提高局部药物浓度，增强溶栓效果。
其他辅助治疗措施
一般支持治疗： 患者需要绝对卧床休息，密切监测生命体征，如呼吸、心率、血压等。同时要保持大便通畅，避免用力排便增加腹压，影响心肺功能。对于有呼吸困难的患者，可能需要吸氧治疗，改善缺氧状况。呼吸循环支持： 如果患者出现呼吸衰竭，可能需要机械通气来维持呼吸功能。对于出现休克等循环衰竭表现的患者，需要积极进行液体复苏等循环支持治疗，维持血压稳定。