巨细胞病毒感染主要是由巨细胞病毒引起的。人体感染巨细胞病毒的途径有多种。首先是先天性感染，孕妇如果在孕期感染了巨细胞病毒，病毒有可能通过胎盘传播给胎儿，据相关研究，孕妇原发感染巨细胞病毒时，胎儿的感染率约为30% - 40%。
通过密切接触传播
唾液传播： 比如在日常生活中，一起吃饭、亲吻等密切接触行为，可能会通过唾液传播巨细胞病毒。例如，家长亲吻婴儿时，就有可能将自身携带的巨细胞病毒传染给婴儿。接触污染物传播： 接触被巨细胞病毒污染的物品后，再接触口腔、鼻腔等黏膜部位，也容易感染。比如共用毛巾、餐具等，如果上面沾染了含有巨细胞病毒的分泌物，就可能造成传播。
通过体液传播
血液传播： 输血或器官移植等情况，如果输入了含有巨细胞病毒的血液或者移植了带有病毒的器官，就会直接导致感染。例如，在一些医疗输血操作中，如果血液筛查不严格，就可能传播巨细胞病毒。性传播： 巨细胞病毒也可以通过性接触传播，这也是成人感染巨细胞病毒的重要途径之一。在无保护措施的性行为中，病毒可以通过性接触部位的黏膜等进行传播。
通过母婴传播（除先天性感染外）
产道传播： 新生儿在出生时通过产道，接触到母亲产道中含有巨细胞病毒的分泌物，也会发生感染。这种情况在孕妇原发感染巨细胞病毒时更容易发生，因为此时母亲体内病毒载量较高。