小便的时候尿道疼痛，可能与以下几种情况有关：
1.尿道炎：尿道炎是尿道黏膜的炎症，可由细菌、病毒等感染引起。除了尿道疼痛，还可能伴有尿频、尿急、尿道口红肿等症状。治疗尿道炎通常采用抗生素治疗，如左氧氟沙星、阿莫西林等。
2.膀胱炎：膀胱炎是膀胱黏膜的炎症，也可导致尿道疼痛。此外，还可能出现尿频、尿急、尿痛、下腹部疼痛等症状。膀胱炎的治疗方法与尿道炎类似，常用药物包括头孢呋辛酯、三金片等。
3.前列腺炎：前列腺炎是男性常见的疾病，可引起尿道疼痛、尿频、尿急、尿痛、排尿困难等症状。治疗前列腺炎需要综合治疗，包括药物治疗、物理治疗等。药物治疗常用的有前列康、前列舒通等。
4.尿道结石：尿道结石可阻塞尿道，导致排尿不畅，并引起尿道疼痛。较小的结石可以通过多喝水、服用排石药物等方法排出体外；较大的结石则需要进行手术治疗。
5.其他原因：尿道口炎、尿道憩室、尿道损伤等也可能导致尿道疼痛。
如果出现小便时尿道疼痛的症状，建议及时就医，进行相关检查，如尿液检查、超声检查等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意个人卫生，多喝水，避免憋尿，少吃辛辣刺激性食物。如果是女性，在性生活前后要注意清洗外阴，避免感染。如果是男性，要注意保持尿道口清洁，避免久坐、憋尿等。