小便的时候尿道痛可能由多种原因引起。比如尿道炎就比较常见，大约有30% - 50%的尿道炎患者会出现小便尿道痛的症状。
尿道炎导致尿道痛
细菌感染引发的尿道炎： 大肠埃希菌等常见细菌感染尿道后，会刺激尿道黏膜，导致尿道黏膜充血、水肿，从而引起小便时尿道痛。患者还可能伴有尿频、尿急等症状，有时尿道口会有分泌物。非淋菌性尿道炎： 由支原体、衣原体感染引起，也会出现尿道痛的情况，症状相对细菌感染的尿道炎可能稍轻，但也会影响正常排尿。
膀胱炎引起尿道痛
急性膀胱炎： 主要是细菌感染膀胱所致，除了尿道痛，还可能有尿频、尿急，严重时会出现血尿。一般来说，女性患急性膀胱炎的概率相对较高，这与女性尿道短、宽的生理结构有关。慢性膀胱炎： 多由急性膀胱炎迁延不愈而来，尿道痛症状可能时轻时重，患者会反复出现排尿不适的情况。
泌尿系统结石造成尿道痛
输尿管结石： 当输尿管结石向下移动时，会刺激输尿管黏膜，引起尿道痛，这种疼痛往往比较剧烈，呈绞痛样。同时可能伴有腰痛、血尿等症状，结石较小的话有可能自行排出体外。膀胱结石： 膀胱结石会刺激膀胱黏膜，导致尿道痛，患者在排尿过程中结石移动还可能出现排尿中断的现象。
其他可能因素
尿道损伤： 如性生活时过于粗暴、外力撞击等导致尿道损伤，小便时会出现尿道痛，还可能有尿道出血的情况。过敏反应： 对某些物质过敏，如使用了不合适的卫生用品等，也可能引起尿道黏膜过敏反应，出现尿道痛。