皮肤萎缩的治疗方法需根据病因等情况来定。对于因糖皮质激素使用导致的皮肤萎缩，一般停用激素后部分可逐渐改善，但可能需要数周甚至数月时间。
局部药物治疗
外用保湿剂： 像尿素乳膏等保湿剂可以使用，能帮助改善皮肤干燥状况，一定程度上缓解因皮肤萎缩带来的不适，长期使用有助于维持皮肤水分。维A酸类药物： 外用维A酸可能对某些原因引起的皮肤萎缩有一定作用，不过使用时要注意可能出现刺激反应，比如局部发红、脱屑等情况，一般需要在医生指导下谨慎使用。
光电治疗
激光治疗： 点阵激光是一种可选方法，它可以刺激皮肤胶原蛋白增生，对改善皮肤萎缩有一定效果。一般需要多次治疗，每次治疗间隔数周，具体次数根据皮肤萎缩程度等决定。光子嫩肤： 对于一些因光老化等导致的皮肤萎缩，光子嫩肤有一定改善作用，能刺激皮肤的修复机制，促进皮肤状态的改善，但也需要多次治疗才能看到较明显效果。
手术治疗
皮肤磨削术： 适用于某些局限性皮肤萎缩情况，通过磨削皮肤表面，刺激新的皮肤组织生长。不过术后要注意护理，避免感染等问题，恢复时间一般需要1 - 2周左右，而且术后皮肤可能会有短暂的发红等情况。自体脂肪填充： 如果是面部等部位因脂肪丢失等导致的皮肤萎缩，可以考虑自体脂肪填充，将自身其他部位的脂肪移植到萎缩部位，填充后能改善皮肤凹陷等萎缩表现，但脂肪存活情况会影响效果，部分人可能需要再次填充。
综合治疗方案
有些情况可能需要综合治疗，比如同时采用药物治疗配合光电治疗。例如因糖尿病引起的皮肤萎缩，一方面要控制血糖，另一方面可能结合外用药物保湿以及适当的光电治疗来改善皮肤状况。在治疗过程中要定期复诊，根据皮肤恢复情况调整治疗方案，同时要注意避免进一步损伤皮肤，比如避免过度暴晒、避免滥用刺激性强的化妆品等。