甲状腺激素低通常称为甲状腺功能减退，其原因有多种。比如自身免疫性疾病，像慢性淋巴细胞性甲状腺炎（桥本病），约占原发性甲减病因的80% - 90%，机体免疫系统错误地攻击甲状腺组织，导致甲状腺受损，合成甲状腺激素减少。
一、自身免疫相关因素
1. 自身免疫性甲状腺炎自身免疫性甲状腺炎是常见原因之一。除了桥本病，还有萎缩性甲状腺炎也会引发甲状腺激素低。萎缩性甲状腺炎患者体内存在自身抗体，破坏甲状腺细胞，影响甲状腺正常功能，使甲状腺激素分泌不足。2. 其他自身免疫性疾病关联一些其他自身免疫性疾病也可能间接导致甲状腺激素低。例如1型糖尿病患者，同时患甲状腺功能减退的概率比普通人高，这可能与共同的自身免疫机制有关，自身免疫反应不仅攻击胰腺β细胞导致糖尿病，还可能波及甲状腺。
二、甲状腺手术或放射性碘治疗因素
1. 甲状腺手术当因甲状腺结节、甲状腺癌等疾病进行甲状腺手术时，如果切除甲状腺组织过多，剩余甲状腺组织不能合成足够的甲状腺激素，就会出现甲状腺激素低的情况。一般切除甲状腺组织超过60%时，就较容易发生甲减。2. 放射性碘治疗放射性碘治疗常用于甲亢的治疗，利用放射性碘被甲状腺摄取后破坏甲状腺组织。但如果治疗剂量把握不当，或者患者个体差异，可能会过度破坏甲状腺组织，导致甲状腺激素合成减少。通常在放射性碘治疗后数月至数年可能逐渐出现甲状腺功能减退。
三、药物及其他因素
1. 药物影响某些药物会影响甲状腺激素的合成或作用。比如胺碘酮，它含碘量较高，长期服用可能干扰甲状腺激素代谢，导致甲状腺功能减退。还有锂剂，长期使用锂剂治疗精神疾病等情况时，可能抑制甲状腺激素的合成，引起甲状腺激素水平降低。2. 碘缺乏或过量碘是合成甲状腺激素的重要原料，碘缺乏地区的人群如果饮食中碘摄入不足，会导致甲状腺激素合成减少，引发甲状腺功能减退。而长期过量摄入碘，也可能影响甲状腺正常功能，导致甲状腺激素低。例如长期大量食用含碘丰富的食物，加上饮水碘含量高，就可能出现这种情况。