胎记形成的原因目前还不完全明确，一般认为可能与胚胎发育过程中某些因素有关。比如，部分胎记可能是由于基因变异引起的，据研究，约有一定比例的胎记与遗传基因的异常变化相关。
血管异常导致的胎记
鲜红斑痣：这是一种常见的血管性胎记，是由于胚胎发育时，特定部位的血管发育异常所致。它表现为淡红色或暗红色的斑片，通常不会自行消退，会随着年龄增长而颜色加深、面积扩大。一般在出生时或出生后不久出现，好发于头面部等部位。草莓状血管瘤：属于血管增生引起的胎记，多在出生后1-2个月内出现，初起为小的红色斑点，然后迅速增长，隆起成草莓状的肿物，质地柔软，好发于头颈部等部位。其发生与血管内皮细胞的异常增殖有关。
色素异常引起的胎记
太田痣：一般认为是胚胎发育时，黑素细胞从神经嵴向表皮移行期间停留在真皮深部而引起的。太田痣多表现为单侧面部的蓝灰色、灰褐色等色素沉着斑，颜色深浅不一，常在儿童时期出现，也有部分人在青春期前后加重。咖啡斑：病因可能与遗传有关，是一种较为常见的色素沉着性胎记，表现为边界清楚的圆形、卵圆形或不规则形的淡褐色至深褐色斑片，大小不一，可在出生时或出生后不久出现，可发生于身体的任何部位，且数目可能会随着年龄增长而增多。
皮肤组织增生导致的胎记
皮脂腺痣：是由皮脂腺等皮肤附属器构成的一种错构瘤，多于出生时或出生后不久发生，表现为单个或多个圆形、卵圆形的黄色或棕褐色斑块，表面光滑，随着年龄增长，斑块会逐渐增厚、出现结节等改变，好发于头面部等部位。疣状痣：病因可能与表皮细胞发育过度有关，表现为淡黄色至棕黑色的疣状损害，呈线状排列，可发生于身体的任何部位，通常在出生时或幼儿期发病，但也可在儿童期甚至成年期出现，其损害的大小和形状不等。