在月经干净12天后进行性行为，存在怀孕的可能。如果女性月经周期规律，月经持续时间在3-7天左右，月经干净12天时可能处于排卵期，此时同房怀孕的几率较高。但如果女性月经周期不规律，或者月经持续时间较长，那么排卵期也会相应推迟或提前，此时同房怀孕的几率则相对较低。
除了怀孕，在月经干净12天后进行性行为，还可能出现以下情况：
1.妇科炎症：月经期间，女性的宫颈口处于开放状态，此时进行性行为，容易将细菌带入阴道，引起上行感染，导致子宫内膜炎、盆腔炎等妇科炎症。
2.子宫内膜异位症：月经期间进行性行为，可能导致经血倒流，使子宫内膜碎片种植在子宫以外的部位，引起子宫内膜异位症，导致痛经、性交痛等症状。
3.免疫性不孕：月经期间进行性行为，可能导致精子和子宫内膜细胞在体内产生免疫反应，影响受精卵的着床和发育，导致免疫性不孕。
因此，如果没有怀孕的计划，建议在月经干净3天后再进行性行为，并采取有效的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药等。同时，也要注意个人卫生，保持外阴清洁，避免感染。如果出现白带异常、腹痛、阴道出血等异常情况，应及时就医，以免延误病情。