一般来说，月经干净3天同房怀孕的几率较小，但仍有可能怀孕。
月经周期一般为21至35天，平均28天。月经周期的第1至第7天为月经期，此时子宫内膜脱落，伴有阴道流血；随后进入卵泡期，此阶段卵巢内的卵泡逐渐发育成熟；排卵通常发生在下次月经来潮前14天左右，排卵前后4至5日为易孕期，此时期同房怀孕的几率较大；排卵后卵巢形成黄体，分泌孕激素，子宫内膜进入分泌期，若卵子未受精，黄体在排卵后9至10天开始萎缩，孕激素水平下降，子宫内膜失去支持而脱落，月经来潮。
因此，月经干净3天通常处于安全期，但由于个体差异，排卵时间可能提前或推后，所以安全期避孕的方法并不可靠，若没有怀孕计划，建议采取更为可靠的避孕措施。