男性支原体感染后，不同部位感染表现不同。比如泌尿生殖道感染时，约1-3周会出现症状，主要表现为尿道刺痛，还可能伴有不同程度的尿急、尿频、排尿刺痛，特别是当尿液较为浓缩的时候明显。尿道口可能会有轻度红肿，分泌物稀薄，量少，为浆液性或脓性，多需用力挤压尿道才见分泌物溢出。
泌尿生殖道感染表现
尿道不适表现： 除了尿道刺痛、尿急尿频外，部分患者还可能感觉尿道内瘙痒，尤其在安静状态下比较明显。有些患者晨起时会发现尿道口有少量稀薄分泌物，呈浆液性或轻度脓性。合并其他问题时表现： 如果支原体感染合并附睾炎，会出现阴囊部位疼痛、肿大，触摸时疼痛明显，还可能伴有发热等全身症状；如果合并前列腺炎，可能会有会阴部坠胀不适、下腹部隐痛等表现，部分患者还可能出现射精疼痛等情况。
呼吸道感染表现
初期症状： 支原体感染引起呼吸道感染时，起病较缓慢，初期可能有乏力、头痛等全身症状。之后会出现咳嗽，多为刺激性干咳，咳嗽可持续较长时间，有的患者咳嗽会持续2-3周甚至更久。伴随症状： 咳嗽时可能伴有少量黏痰，一般没有明显的咯血情况。部分患者可能会有发热，体温一般为中度发热，在38℃左右，也有少数患者会出现高热。
其他部位感染表现
眼部感染表现： 支原体感染累及眼部时，可引起结膜炎，表现为眼睛发红、流泪、有异物感，眼部可能会有少量分泌物，一般为浆液性分泌物。咽部感染表现： 若支原体感染咽部，可出现咽部不适、疼痛，咽部充血，有的患者会有咽干的感觉，可能会影响吞咽，但一般不会出现严重的吞咽困难情况。