生殖器疱疹与毛囊炎在多个方面存在区别，主要包括感染类型不同、临床症状不同、治疗方法不同。当患者出现相关症状时，应前往医院，由专业医生进行判别，以明确具体类型。
一、感染类型不同：
1.生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒感染引发的皮肤疾病，可通过性行为传播。
2.毛囊炎大多由金黄色葡萄球菌感染引起，少部分也可能是由铜绿假单胞菌、马拉色菌导致，通常不具有传染性。
二、临床症状不同：
1.生殖器疱疹患者主要在生殖器周围的皮肤上出现水疱，水疱数量较多且密集，常伴有不同程度的灼热感或疼痛感。
2.毛囊炎患者可在全身各处出现丘疹样皮肤损害，通常数量较少，有时会伴有疼痛，但一般不明显。
三、治疗方法不同：
1.生殖器疱疹患者需进行抗病毒治疗，可在医生指导下服用阿昔洛韦、伐昔洛韦等药物，或外用阿昔洛韦乳膏。
2.毛囊炎患者要针对不同病原体采取相应治疗措施。若为细菌感染，可外用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏，或口服阿莫西林、四环素等。若为真菌感染，则可外用特比萘芬乳膏、酮康唑洗剂等，或口服伊曲康唑、氟康唑等。
总之，要准确区分生殖器疱疹与毛囊炎，可从上述方面进行判断，以便采取正确的治疗措施。