生殖器疱疹与毛囊炎在多个方面存在区别，包括感染类型不同、临床症状不同、治疗方法不同。若患者出现相关症状，应前往医院，由专业医生进行判别以明确具体类型。
一、感染类型不同：
1.生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒感染引起的皮肤疾病，可通过性行为传播。
2.毛囊炎主要由金黄色葡萄球菌感染导致，少数也可能是铜绿假单胞菌、马拉色菌引起，通常无传染性。
二、临床症状不同：
1.生殖器疱疹患者主要表现为生殖器周围皮肤出现水疱，水疱数量多且密集，伴有不同程度的灼热感或疼痛感。
2.毛囊炎患者全身各处都可能出现丘疹样皮肤损害，通常数量较少，有时伴有疼痛，但不明显。
三、治疗方法不同：
1.生殖器疱疹患者需进行抗病毒治疗，可在医生指导下服用阿昔洛韦、伐昔洛韦等药物，或外涂阿昔洛韦乳膏。
2.毛囊炎患者要针对不同病原体采取不同治疗措施。若为细菌感染，可外涂莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏，或口服阿莫西林、四环素等；若为真菌感染，可外用特比萘芬乳膏、酮康唑洗剂等，或口服伊曲康唑、氟康唑等。
总之，生殖器疱疹和毛囊炎在诸多方面存在差异，通过对这些方面的准确判别，有助于正确诊断和治疗。