肛窦炎主要症状表现为肛门部位的不适，一般来说，患者常常会有肛门坠胀感，这种坠胀感可能会持续存在，有时候在排便后可能会更加明显。另外，疼痛也是常见症状之一，疼痛程度有所不同，有的患者是轻微的隐痛，有的则可能较为明显，部分患者还可能出现肛门部的灼热感。
局部症状表现
肛门坠胀感： 患者会感觉肛门有下坠的感觉，就像总是有便意但又排不净一样，这种坠胀感在久坐、久站或者活动后可能会加重。比如有些患者连续坐了1个多小时后，肛门坠胀感会明显增强。疼痛情况： 轻度的肛窦炎可能只是偶尔有隐隐的刺痛，而较为严重的肛窦炎疼痛会比较明显，可能呈针刺样或者刀割样疼痛，在排便时由于粪便刺激发炎的肛窦，疼痛往往会加剧。
伴随症状情况
分泌物增多： 肛窦发炎后，会刺激肛门腺体分泌增多，患者会发现肛门有少量的黏液流出，这些黏液有时候会污染内裤，让患者感觉肛门潮湿不适。排便异常： 部分肛窦炎患者可能会出现排便习惯的改变，比如排便次数增多，或者出现便秘的情况。这是因为炎症刺激直肠肛门部位，影响了正常的排便功能。
全身症状表现
一般来说，肛窦炎的全身症状比较少见，但如果炎症比较严重，感染扩散，可能会引起全身不适，比如少数患者可能会出现低热的情况，体温一般在37.5℃左右，不过这种情况相对比较少见。大多数肛窦炎患者主要还是以局部的肛门坠胀、疼痛、分泌物增多等症状为主。