系统彩超和四维彩超主要在成像原理、检查时间及适用情况等方面存在区别。系统彩超是二维超声的动态显示，而四维彩超是在系统彩超基础上加上时间维度，形成动态的立体图像。
成像原理差异
系统彩超是基于二维超声技术，通过探头发射和接收超声波，获取胎儿等检查部位的二维平面图像信息。四维彩超则是在三维超声的基础上，加上时间维度，能够实时获取胎儿等的动态立体图像，就像给检查对象拍摄一段“小视频”。
检查时间不同
系统彩超一般建议在妊娠20 - 24周进行，此时胎儿的大部分器官已发育成形，可对胎儿进行较为全面的结构筛查。四维彩超的最佳检查时间相对较宽，通常在妊娠22 - 28周，不过具体时间可能因个体差异和医院检查安排有所不同。
适用情况有别
系统彩超主要侧重于对胎儿结构的详细检查，排查胎儿是否存在大体结构畸形等问题。四维彩超除了能进行结构筛查外，还可用于胎儿的实时动态观察，比如记录胎儿在宫内的活动情况等，但在一些对胎儿结构细节精准判断上，系统彩超可能有其独特优势。
对孕妇影响
两种检查对孕妇身体的影响都较小，一般不会有明显不适。不过四维彩超由于成像时间可能相对较长，孕妇需要保持相对稳定的体位时间可能稍长，但总体差异不大。对于特殊人群如高龄孕妇等，系统彩超和四维彩超都可根据具体情况进行选择，以更好地监测胎儿状况。