肾结石是由于尿液中某些物质浓度过高，从尿液中析出形成固体物质，逐渐聚集而成。一般来说，尿液中钙、草酸、尿酸、胱氨酸等成分含量异常是形成肾结石的关键因素。
代谢异常导致的成分过饱和
尿液中钙含量过高：当人体血液中钙的浓度升高，肾脏滤过的钙增多，若尿液中钙不能及时排出，就容易形成钙盐结晶，进而发展为肾结石。例如，原发性甲状旁腺功能亢进患者，会出现血钙升高，增加肾结石形成风险。尿酸代谢紊乱：体内尿酸生成过多或排泄减少，会使尿液中尿酸浓度升高，尿酸结晶析出，引发尿酸结石。像一些患有痛风的患者，由于尿酸代谢异常，就较易长尿酸结石。
尿路梗阻相关因素
尿道狭窄：尿道出现狭窄情况时，尿液排出受阻，尿液中的晶体物质容易在局部沉积，久而久之形成结石。比如先天性尿道狭窄的患者，就比常人更易长肾结石。前列腺增生：中老年男性常见前列腺增生，增生的前列腺会压迫尿道，导致尿液排出不畅，尿液中的成分易滞留形成结石。
感染因素影响
细菌感染：泌尿系统受到细菌感染时，细菌、脓块等会作为核心，促使尿液中的矿物质围绕其沉积形成结石。例如，大肠杆菌感染泌尿系统后，就可能引发感染性肾结石。尿素分解细菌：这类细菌能分解尿液中的尿素，使尿液碱化，导致磷酸镁铵及磷酸钙等晶体易在尿路中沉积形成结石。
饮食与生活习惯因素
饮水不足：每天饮水量少于1500毫升，尿液会浓缩，尿液中晶体物质浓度升高，增加结石形成几率。一般建议肾结石患者每天饮水量应达到2000 - 3000毫升以上。高草酸食物摄入过多：长期大量吃菠菜、苋菜、巧克力等富含草酸的食物，会使尿液中草酸含量增加，容易与钙结合形成草酸钙结石。比如每天大量食用菠菜，就会提高患草酸钙结石的风险。