肝囊肿是较常见的肝脏良性疾病，多数患者无明显临床表现，仅约5% - 10%的患者可能出现相关症状。
无症状表现
多数肝囊肿体积较小，对肝脏及周围组织无明显压迫，也不影响肝脏正常功能，这类患者通常没有任何不适症状，往往是在体检做超声等影像学检查时偶然发现。
压迫相关表现
压迫胃肠道
当肝囊肿较大时，可能会压迫胃肠道，导致患者出现腹胀、食欲减退等症状。比如囊肿直径超过5厘米甚至更大时，对胃肠道的压迫可能性增加，部分患者会感觉吃饭后肚子饱胀感明显，不想多吃东西。
压迫胆管
若肝囊肿压迫胆管，可能引起黄疸，表现为皮肤和巩膜发黄，小便颜色加深如浓茶色，大便颜色变浅等。一般囊肿压迫胆管导致胆汁排泄不畅时，就可能出现这类黄疸相关表现。
囊肿破裂相关表现
破裂出血
少数情况下，肝囊肿可能发生破裂出血，患者会突然出现右上腹剧烈疼痛，同时可能伴有面色苍白、心慌、出冷汗等失血表现。如果囊肿本身有出血倾向或者受到外力撞击等因素，就容易发生破裂出血情况。
破裂感染
肝囊肿破裂后还可能继发感染，患者会出现发热、寒战等感染症状，体温可能升高至38℃以上，同时右上腹疼痛可能持续不缓解，并且有加重趋势。
特殊类型肝囊肿表现
寄生虫性肝囊肿
比如肝包虫囊肿，除了可能有上述一般肝囊肿的表现外，还可能有过敏反应，像皮肤瘙痒、皮疹等，若包虫囊肿破裂，还可能引起过敏性休克等严重情况。因为肝包虫是寄生虫感染导致，有其特殊的致病过程和表现。
先天性肝囊肿相关表现
有些先天性肝囊肿患者可能同时合并其他脏器的囊肿，如多囊肾，此时可能会出现肾功能异常相关表现，像尿量减少、水肿等，因为多囊肝和多囊肾往往是遗传性疾病，相互关联。