患灰指甲可以通过药物治疗、手术治疗等方法处理。一般来说，外用药物治疗疗程较长，可能需要数月，而口服抗真菌药物相对见效快些，但需在医生评估下使用。
外用药物选择
阿莫罗芬搽剂： 每周使用1 - 2次，直接涂抹在病甲上，它能抑制真菌细胞膜的合成，从而发挥抗真菌作用。使用时要先清洁病甲，保持干燥后再涂抹。不过，它对于较严重的灰指甲效果可能相对有限。环吡酮胺乳膏： 每天涂抹病甲周围皮肤2次左右，适用于轻度灰指甲。它可以改变真菌细胞膜的完整性，影响真菌的代谢过程。但要注意避免接触眼睛和其他黏膜部位。
口服药物治疗
伊曲康唑： 采用冲击疗法，即每月服药1周，连续服用3 - 4个月。它是一种合成的三氮唑类抗真菌药，能高度选择性干扰真菌的细胞色素P450的活性，从而抑制真菌细胞膜上麦角固醇的合成。不过，肝功能不全者要慎用，使用前需检查肝功能。特比萘芬： 一般每天口服一次，连续服用12周左右。它能特异性地抑制真菌角鲨烯环氧化酶，阻碍真菌细胞膜角鲨烯环氧化反应，导致真菌细胞膜形成障碍而死亡。但有严重肝肾功能不全者要谨慎使用。
手术治疗情况
拔甲术： 对于单发的灰指甲可以考虑拔甲，但创伤较大，术后恢复需要一定时间，而且新长出来的指甲也有可能再次感染真菌。通常在局部麻醉下进行，将病甲拔除，术后要保持伤口清洁，防止感染。激光治疗： 利用特定波长的激光照射病甲，破坏真菌生存环境。一般需要多次治疗，每次治疗时间较短，相对痛苦较小，但费用可能较高，而且对于一些严重的灰指甲可能效果不是特别理想。