药流会流不干净的原因通常包括怀孕时间较长、子宫位置不正常以及对药物不敏感。
一、怀孕时间长：药物流产一般适用于怀孕40天到49天以内的妊娠。如果怀孕时间超出这个范围较长，那么药物的效果可能就会大打折扣，进而导致流产不完全。因为怀孕时间长时，胚胎相对较大，药物对其作用可能不够充分，难以使其完全排出。
二、子宫位置不正常：子宫位置不正常主要涵盖过度前屈或后屈的情况。在药物流产后，可能由于这种不正常的子宫位置，使得胚胎组织无法顺利地排出体外，从而引发流产不全。比如过度前屈的子宫，可能会影响药物与胚胎的充分接触以及胚胎排出的通道；而过度后屈的子宫也会在一定程度上阻碍胚胎的顺畅排出。
三、药物不敏感：如果自身对药物的反应不够灵敏，服药后可能无法有效地将胚胎杀死或使其排出。有的人可能存在个体差异，对药物的敏感性较低，这就导致药物不能很好地发挥其应有的作用，最终造成流产不全等不良后果。
流产不全往往会伴有腹部疼痛、阴部出血增多以及出血时间延长等症状。对于这种情况，可以先尝试口服新生化颗粒进行治疗，而如果情况较为严重，则需要进行清宫手术来处理。总之，药流后要密切关注身体状况，一旦发现异常应及时就医处理。