怀孕三个月肚子疼可能存在多种情况，具体如下：
一、正常表现：怀孕后随着胚胎不断生长发育，子宫腔内容积逐渐变大，膨大的子宫对腹壁形成一定挤压，从而可能引发肚子疼。
二、先兆流产：怀孕三个月时，若孕妇遭受剧烈精神刺激或腹部受到外力撞击，可能诱发子宫收缩导致先兆流产，使孕妇出现肚子疼，同时还可能伴有阴道流血、腰骶部酸痛等症状。
三、盆腔炎：怀孕三个月期间，若孕妇身体免疫功能下降，细菌等病原体进入盆腔，就可能引起盆腔组织出现炎性病变，导致孕妇肚子疼，还可伴有分泌物增多、有异味、发热、寒战、倦怠、疲乏等表现。
总之，引起孕妇三个月肚子疼的原因较多，需要在专业医生指导下，依据具体病因进行相应治疗。