怀孕三个月肚子有点隐隐作痛可能是正常的生理现象，但也可能是某些潜在问题的信号。以下是一些可能的原因：
1.子宫增大：怀孕后，子宫会逐渐增大，以适应胎儿的生长。这个过程中，子宫可能会有一些不适感，包括隐隐作痛。
2.子宫韧带拉伸：子宫周围的韧带也会随着子宫的增大而被拉伸，这可能会引起轻微的疼痛。
3.消化问题：怀孕期间，消化系统可能会受到影响，例如消化不良、便秘等，这些问题也可能导致肚子隐隐作痛。
4.其他因素：情绪紧张、身体疲劳、过度运动等也可能引起肚子隐痛。
然而，如果疼痛持续加重、伴有阴道出血、发热等症状，或者疼痛非常剧烈，无法忍受，应立即就医，以排除其他潜在的问题，如先兆流产、宫外孕等。
需要注意的是，每个女性的身体状况和怀孕情况都不同，如果对肚子隐隐作痛感到担忧或不安，最好咨询医生的意见。医生会进行详细的身体检查和评估，根据具体情况提供个性化的建议和诊断。
此外，在怀孕期间，保持良好的生活习惯也很重要，包括均衡饮食、适量运动、充足休息、避免过度劳累和紧张等。遵循医生的建议，定期进行产前检查，有助于确保孕妇和胎儿的健康。