甲状腺疼痛发炎多是由甲状腺炎引起，比如亚急性甲状腺炎，通常在病毒感染后1~3周发病，约50%的患者有上呼吸道感染前驱症状。
亚急性甲状腺炎导致的疼痛发炎
病因方面：多与病毒感染有关，像柯萨奇病毒、腮腺炎病毒等感染后，免疫系统攻击甲状腺，引发炎症反应。症状表现：患者甲状腺部位会出现明显疼痛，疼痛可放射至耳部，同时可能伴有甲状腺肿大、发热等症状，体温一般在38~39℃左右。
自身免疫性甲状腺炎引发的情况
桥本甲状腺炎活动期：自身免疫系统错误地攻击甲状腺组织，在活动期也可能出现甲状腺疼痛发炎。特点：起病比较隐匿，早期可能没有明显症状，随着病情发展，当处于活动期时，甲状腺会有不同程度的疼痛、肿大，血液中甲状腺自身抗体，如甲状腺过氧化物酶抗体（TPOAb）、甲状腺球蛋白抗体（TgAb）会明显升高。
感染性甲状腺炎的情况
细菌感染：如葡萄球菌、链球菌等感染甲状腺，也会导致甲状腺疼痛发炎。表现：局部会有红、肿、热、痛的典型炎症表现，患者除了甲状腺疼痛外，还可能伴有全身感染症状，像寒战、高热等，血常规检查会发现白细胞计数及中性粒细胞比例升高。