没来月经但内裤上有褐色分泌物，可能的原因包括排卵期出血、宫颈外翻、宫颈息肉等。
一、排卵期出血：如果没有伴随不适症状，且出血时间处于两次月经中间的一段时间，这很可能是排卵期出血。部分女性在排卵期时，由于体内激素水平会出现一过性下降，可能导致少量子宫内膜脱落，进而出现出血现象，因出血量较少，所以呈现为褐色分泌物。
二、宫颈外翻：倘若内裤上的褐色分泌物是在性交之后出现，那么可能是宫颈外翻。这主要是因为在分娩、引产或流产时发生宫颈撕裂，而又未能及时进行修补，宫颈外翻可能会引发子宫接触性出血，如果同时合并了慢性宫颈炎，还可能会伴有白带增多的情况。
三、宫颈息肉：若伴有月经失调、月经量比平时多等情况，也可能是宫颈息肉。大部分宫颈息肉没有临床症状，多在妇科检查中被发现，患者会出现月经失调以及性交后出血的症状，由于出血量少，也会表现为褐色分泌物。
总之，当出现没来月经但内裤有褐色分泌物的情况时，可能是多种原因导致的，需要根据具体的表现和相关检查来明确诊断，以便采取合适的治疗措施。