第三代试管成功率受到多种因素影响，一般在30% - 60%左右，但具体成功率因个体差异等因素有所不同。
年龄因素影响
年龄是影响第三代试管成功率的重要因素。女性年龄越小，卵子质量相对越好，子宫环境等也更有利于胚胎着床，成功率相对较高；随着女性年龄增长，尤其是35岁以后，卵子质量下降、染色体异常几率增加，成功率会逐渐降低。男性年龄过大也可能影响精子质量，进而影响成功率。
不孕原因差异
如果是因为染色体异常等遗传性疾病导致的不孕，通过第三代试管技术可以筛选出正常胚胎进行移植，成功率相对有针对性因素时可能会相对较好；而如果是其他如输卵管堵塞等非遗传性因素导致的不孕，第三代试管成功率则与普通试管婴儿成功率范围相近，但仍受其他因素综合影响。
胚胎质量影响
胚胎质量是关键。优质胚胎着床能力强，成功率相对高；质量较差的胚胎即使进行第三代试管，着床及发育成健康胎儿的几率也会降低。胚胎质量受多种因素影响，包括卵子和精子的质量、实验室培养条件等。
身体基础状况
女性自身的身体基础状况也很重要。例如患有子宫内膜异位症、子宫肌瘤等疾病时，会影响胚胎着床，降低第三代试管的成功率；而身体状况良好、无严重基础疾病的女性，成功率相对更高。同时，心理状态也会对成功率产生影响，长期焦虑、紧张等不良情绪可能会影响内分泌，进而影响胚胎着床。