如果三个月没来月经，且没有怀孕，可能是由以下原因引起的：
1.内分泌失调：长期的压力、情绪波动、熬夜等因素可能导致内分泌紊乱，影响月经周期。此外，一些疾病，如多囊卵巢综合征，也可能导致激素水平异常，引起月经失调。
2.卵巢功能问题：卵巢早衰、早发性卵巢功能不全等问题可能导致卵巢无法正常分泌激素，从而影响月经。
3.其他因素：体重急剧变化、过度运动、甲状腺功能异常等也可能对月经产生影响。
如果三个月没来月经，即使身体没有其他异常，也建议及时就医。医生通常会进行详细的问诊和身体检查，可能会包括以下步骤：
1.进行妊娠试验：排除怀孕的可能性。
2.检查激素水平：通过血液检查，了解体内激素的情况，以评估卵巢功能。
3.进行盆腔超声检查：观察子宫和卵巢的结构，排除其他潜在的问题。
4.其他检查：根据具体情况，医生可能会建议进行其他检查，如甲状腺功能检查等。
治疗方法将根据病因而定。以下是一些可能的治疗措施：
1.调整生活方式：保持良好的作息习惯，避免熬夜；减轻压力，保持心情愉悦；合理饮食，适当运动等。
2.激素治疗：如果是激素失衡引起的月经问题，医生可能会开具激素药物来调节月经周期。
3.针对病因治疗：如果存在其他潜在疾病，如多囊卵巢综合征，可能需要进一步的治疗来解决根本问题。
4.辅助生殖技术：在某些情况下，如卵巢功能严重衰退，可能需要考虑辅助生殖技术来实现生育。
需要注意的是，每个人的情况都不同，治疗方案应根据个体情况制定。及时就医并遵循医生的建议是解决问题的关键。此外，如果有其他健康问题或疑虑，也应一并告知医生，以便进行全面的评估和治疗。