两个月婴儿打了13价肺炎疫苗后发烧，可能是疫苗的不良反应，也可能是其他原因引起的感染。以下是一些建议：
1.观察体温：使用体温计测量婴儿的体温，注意测量方法要正确。如果体温在38.5℃以下，可以先观察，采用物理降温的方法，如松解衣物、温水擦拭等。
2.保证水分摄入：让婴儿多喝水，以补充因发烧导致的水分流失。
3.注意休息：给婴儿提供安静、舒适的环境，让其充分休息。
4.物理降温：如果体温超过38.5℃，或物理降温后体温不降或再次升高，或婴儿出现精神萎靡、哭闹不止等情况，应及时就医。医生可能会根据具体情况，给予药物治疗，如布洛芬或对乙酰氨基酚等退烧药。
5.就医：如果婴儿发烧持续时间较长、体温较高、伴有其他症状，或对退烧药不敏感，应及时带婴儿去医院就诊，进行相关检查，以排除其他潜在的感染或疾病。
6.避免捂汗：在给婴儿退烧时，不要给其穿过多的衣物或包裹过厚，以免影响散热。
7.注意病情变化：密切观察婴儿的病情变化，包括体温、精神状态、呼吸等，如有异常应及时就医。
需要注意的是，每个婴儿对疫苗的反应可能不同，如果对婴儿的发烧情况有任何疑虑，最好咨询医生的意见。同时，要确保婴儿的接种记录完整，以便医生了解情况并给予正确的建议。