流产40天了还没来月经，其原因可能包括以下方面。
一、子宫内膜损伤：如果是在不正规的机构进行流产清宫操作，因医生技术欠成熟，很容易对子宫内膜造成损伤，甚至可能引发宫腔粘连，进而导致月经不来。子宫内膜损伤后，其修复需要一定时间，在此期间可能出现月经推迟现象。
二、意外妊娠：流产手术后若发生性行为且未做好避孕措施，有可能再次意外怀孕。此时可前往医院检查，通过化验血清中的人绒毛膜促性腺激素，若数值大于25U/L，则大致可判断为妊娠，这也是导致流产后月经推迟的一个因素。
三、宫腔粘连：宫腔粘连是由于子宫内膜受损导致宫腔部分或全部闭塞的疾病，会严重影响女性的生殖生理和身心健康。其可能出现月经异常、周期性腹痛、不孕等症状。
此外，还可能是甲状腺功能亢进症、子宫内膜炎、子宫内膜增生等原因引起。因此，当出现这种情况时，建议患者及时就医，在医生的指导下明确病因，并进行针对性的治疗，以免延误病情。