出现先兆流产的原因较多，其中胚胎因素是常见原因之一，约50% - 60%的先兆流产与胚胎染色体异常有关。
胚胎因素：
染色体数目异常： 多为染色体数目增多，如三体、三倍体等。比如21 - 三体综合征相关的胚胎，就容易出现先兆流产情况。染色体结构异常： 像染色体缺失、易位等结构改变，也会影响胚胎正常发育，增加先兆流产风险。
母体因素：
全身性疾病： 孕妇若患有严重感染，如肺炎等，高热可刺激子宫收缩引发先兆流产；患有糖尿病，血糖控制不佳时，高血糖环境不利于胚胎着床发育，也易导致先兆流产。生殖器官异常： 子宫畸形，如纵隔子宫，会影响胚胎着床及发育空间；宫腔粘连也会对胚胎造成不利影响，增加先兆流产几率。内分泌异常： 黄体功能不全是常见原因，黄体分泌的孕酮不足，不能维持妊娠蜕膜的正常发育，易引起先兆流产；甲状腺功能减退，甲状腺激素分泌不足，也会影响胚胎生长，导致先兆流产。
父亲因素：
精子染色体异常可导致胚胎染色体异常，从而引发先兆流产。虽然男性精子染色体异常相对少见，但也是导致先兆流产的一个因素。
环境因素：
化学物质接触： 孕妇接触过多有害化学物质，如苯、甲醛等，这些物质可能影响胚胎发育，引发先兆流产。放射性物质接触： 长期接触较高剂量的放射性物质，会破坏胚胎细胞结构，干扰胚胎正常发育，增加先兆流产发生的可能性。