肾阳虚多是由多种因素长期作用导致的。从中医角度来看，先天禀赋不足是一个重要原因，比如有些人一出生就存在肾阳根基薄弱的情况。另外，年老体衰也是常见因素，随着年龄增长，人体的阳气会自然衰退，一般人到了一定年纪，比如50岁以后，肾阳亏虚的概率会有所增加。还有久病伤肾，像一些慢性疾病长期不愈，会损耗肾脏阳气，例如患有慢性肾病、慢性咳喘等疾病，病程较长时就容易损伤肾阳。
先天禀赋因素
遗传相关： 如果家族中有肾阳亏虚的遗传倾向，那么后代出生时就可能存在肾阳相对不足的情况。比如家族中多人有畏寒怕冷、腰膝酸软等肾阳不足的表现，其子女先天肾阳就可能相对薄弱。胎儿发育： 在胎儿发育时期，如果母体受到不良因素影响，也可能导致胎儿肾阳禀赋不足。比如母体在孕期营养不良、遭受寒冷侵袭等，都可能影响胎儿肾阳的充盛。
年老体衰因素
生理机能衰退： 随着年龄增长，人体的各个脏器功能逐渐减退，肾脏的阳气也不例外。一般男性到了60岁以后，女性在绝经后，肾阳亏虚的发生率会明显升高。这是因为随着年龄增加，肾脏的精气逐渐衰退，肾阳也随之减弱。代谢减缓： 老年人的新陈代谢相对缓慢，阳气的生成和温煦功能都会下降。比如老年人的基础体温可能会比年轻人略低，这就是肾阳不足，温煦功能减弱的一种体现。
久病伤肾因素
慢性疾病影响： 像慢性肾炎患者，长期的肾脏病变会损耗肾阳。因为肾主水液代谢，慢性肾炎导致肾脏功能受损，进而影响肾阳的温化作用。还有慢性支气管炎患者，长期咳喘会耗伤肺气，而肺与肾的关系密切，肺虚及肾，也会损伤肾阳。疾病治疗影响： 某些疾病在治疗过程中，比如长期使用一些损伤阳气的药物，或者疾病本身的病理过程会损伤肾阳。例如一些长期服用清热泻火药物的患者，可能会出现肾阳受损的情况，表现为畏寒、肢冷等肾阳不足的症状。