肾阳虚通常是多种因素共同作用导致的。比如，长期过度劳累，身体透支，就容易损伤肾阳，有研究发现，长期从事高强度体力劳动或脑力劳动且得不到充分休息的人群，肾阳虚的发生率相对较高。另外，年事已高也是一个重要因素，随着年龄增长，人体的阳气逐渐衰退，到了一定年纪，很多人会出现肾阳虚的表现，60岁以上人群中肾阳虚的比例相对会有所上升。还有，久病不愈也会耗伤肾阳，一些患有慢性疾病，如慢性肾病、慢性支气管炎等，病程较长且未得到有效控制的患者，很容易出现肾阳虚的情况。
先天禀赋因素
先天不足：有些人出生时就存在肾阳亏虚的情况，这与父母的体质以及孕育时的状况有关。如果父母本身肾阳不足，或者在孕期母亲身体状况不佳，就可能导致胎儿先天肾阳禀赋薄弱，出生后容易出现肾阳虚的表现，比如小儿发育迟缓等可能与先天肾阳不足相关。遗传倾向：如果家族中有肾阳虚的遗传倾向，那么后代患肾阳虚的几率相对会增加。例如家族中多人有畏寒怕冷、腰膝酸软等肾阳虚的表现，其后代在相同的环境因素影响下，更容易出现肾阳虚问题。
外邪侵袭因素
寒邪直中：长期处于寒冷潮湿的环境中，寒邪容易侵入人体，损伤肾阳。比如在寒冷的冬季，不注意保暖，长时间待在阴冷的地方，寒邪就会趁机侵犯人体，尤其是腰背部等阳气汇聚的部位，导致肾阳受损。研究表明，长期生活在气温较低、湿度较大地区的人群，肾阳虚的发生率比生活在温暖干燥地区的人群要高约20%。湿邪困阻：湿邪与寒邪相结合，也会影响肾阳的功能。湿邪重浊黏腻，容易阻碍阳气的运行，导致肾阳被遏。比如长期居住在潮湿的环境中，或者经常淋雨、涉水，湿邪侵入体内，就会影响肾阳的正常温煦作用，进而引发肾阳虚。
生活方式因素
过度节食：长期过度节食，摄入的营养物质不足，尤其是缺乏能够温补肾阳的食物，如羊肉、韭菜等，就会导致肾阳亏虚。比如一些为了减肥而过度节食的人群，长期下来容易出现畏寒、乏力等肾阳虚的症状。一般来说，过度节食持续3个月以上，就可能出现肾阳虚相关的表现。缺乏运动：长期缺乏运动，身体的气血运行不畅，阳气得不到很好的激发，也会导致肾阳不足。运动可以促进气血流通，增强阳气，如果长期不运动，阳气生成和运行都会受到影响，久而久之就容易引发肾阳虚。例如长期久坐不动的办公室人群，相比经常运动的人群，肾阳虚的发生率要高30%左右。