怀孕出现先兆流产的原因有多种。大约15%-20%的临床妊娠会发生先兆流产。其中，胚胎因素是常见原因之一，染色体异常是早期流产最常见的原因，约占50%-60%。
母体因素：
内分泌异常： 孕妇体内的激素水平异常可能导致先兆流产。比如，黄体功能不全较为常见，女性怀孕后，黄体需要分泌足够的孕激素来维持妊娠，如果黄体功能不足，孕激素分泌不足，就难以支持胚胎正常发育，从而增加先兆流产风险。甲状腺功能减退也是一个因素，甲状腺激素对胚胎的生长发育很重要，甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，会影响胚胎发育，引发先兆流产。全身性疾病： 孕妇患有某些全身性疾病也可能引发先兆流产。例如，严重的糖尿病未控制好时，高血糖环境不利于胚胎着床和发育；孕妇感染某些病毒，如风疹病毒、巨细胞病毒等，病毒可通过胎盘影响胚胎，导致先兆流产。
父亲因素：
精子染色体异常： 男性精子染色体如果出现异常，也可能影响胚胎质量，增加先兆流产的发生几率。虽然精子染色体异常导致先兆流产的具体机制还在研究中，但大量研究表明，精子染色体异常是导致胚胎发育异常进而引发先兆流产的一个重要原因。
环境因素：
化学物质接触： 孕妇接触过多的有害化学物质也可能引起先兆流产。比如，长期接触铅、汞、苯等有毒化学物质，这些化学物质可能通过胎盘进入胚胎体内，干扰胚胎的正常发育过程，增加先兆流产的发生风险。放射性物质照射： 孕妇接触过量的放射性物质，如接受过大剂量的X射线照射等，放射性物质会对胚胎细胞造成损伤，影响胚胎的正常生长，从而引发先兆流产。