怀孕早期出现先兆流产，主要与胚胎因素、母体因素、父亲因素和环境因素有关。据统计，约50%的先兆流产是胚胎染色体异常导致的。
胚胎因素：染色体异常是主因
染色体数目异常： 常见的有三体、单体等情况，比如21-三体综合征相关的胚胎，很容易在怀孕早期发生先兆流产。染色体结构异常： 像染色体缺失、易位等，也会影响胚胎正常发育，增加先兆流产风险。
母体因素：多种情况需注意
全身性疾病： 孕妇如果患有严重感染，如肺炎等，病原体产生的毒素可能影响子宫内环境，引发先兆流产；患有糖尿病，血糖控制不佳时，高血糖环境不利于胚胎着床和发育，也易导致先兆流产。生殖器官异常： 子宫畸形，比如纵隔子宫，会使子宫腔形态异常，影响胚胎着床和生长；宫颈机能不全，在怀孕中晚期可能出现宫颈口扩张，但早期也可能因宫颈结构问题增加先兆流产几率。内分泌异常： 黄体功能不全是常见原因，女性黄体分泌的孕酮不足，无法很好维持子宫内膜状态，就容易导致先兆流产，临床检测发现约30% - 40%的先兆流产与黄体功能不全有关；甲状腺功能减退，甲状腺激素分泌不足会影响胚胎发育，增加先兆流产发生的可能性。
父亲因素：精子质量有影响
男性精子染色体异常也会对胚胎质量产生不良影响，从而增加怀孕早期先兆流产的发生概率。比如精子染色体碎片率过高时，孕育出的胚胎出现异常的几率升高，进而引发先兆流产。
环境因素：不良接触要避免
孕妇过多接触有害物质，像铅、汞、苯等化学毒物，或者长期处于高辐射环境中，这些不良环境因素会干扰胚胎正常发育，导致先兆流产。另外，孕妇过度劳累、精神过度紧张等，也可能通过神经内分泌系统影响子宫收缩，引发先兆流产。