灰指甲主要由皮肤癣菌等真菌感染引起，治疗药物主要有口服抗真菌药。常用的口服药如伊曲康唑，一般采用冲击疗法，每月服用一周，连续数月，但具体疗程需根据病情而定。
口服抗真菌药种类
伊曲康唑： 属于三唑类抗真菌药物，能抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，从而发挥抗真菌作用。它可以间歇用药，比如每次200mg，每天2次，连服1周，每月重复1个疗程，一般需要2 - 3个疗程。特比萘芬： 是丙烯胺类抗真菌药，能抑制真菌角鲨烯环氧化酶，使真菌细胞内角鲨烯堆积，导致真菌死亡。通常成人剂量为每天250mg，连续服用，指甲癣一般需要连续服用6 - 12周，趾甲癣则需要连续服用12 - 16周。
外用药辅助治疗
阿莫罗芬搽剂： 局部外用，它可以渗透进入甲板，抑制真菌的生长。每周使用1 - 2次，连续使用数月，适用于轻度灰指甲或作为口服药的辅助治疗。使用时要注意先清洁病甲，然后将搽剂均匀涂抹在病甲及周围皮肤上。环吡酮胺乳膏： 局部抗真菌，能改变真菌细胞膜的完整性，影响真菌代谢。可涂抹在病甲处，每天1 - 2次，坚持使用一段时间。
用药注意事项
肝功能不全者慎用： 伊曲康唑和特比萘芬都主要经肝脏代谢，肝功能不全的患者使用时需要密切监测肝功能，因为可能会加重肝脏负担。比如有慢性肝病的患者，在使用这两种药物前，医生会评估肝功能情况，再决定是否用药以及调整剂量。孕妇及哺乳期女性禁用： 口服抗真菌药可能会对胎儿或婴儿产生不良影响，所以孕妇和哺乳期女性不能使用上述的口服抗真菌药物来治疗灰指甲。严格遵医嘱用药： 无论是口服药还是外用药，都要严格按照医生的嘱咐使用，不能自行增减药量或停药。比如口服伊曲康唑时，一定要按照冲击疗法的周期来服用，不能觉得症状缓解就擅自停药，否则容易导致病情复发或真菌耐药。