治疗灰指甲常用的药物主要有外用抗真菌药和口服抗真菌药。一般来说，外用药物疗程较长，可能需要数月，而口服药物起效相对快些，但要注意肝肾功能等问题。
外用抗真菌药
阿莫罗芬搽剂：它是一种局部外用的抗真菌药物，通过抑制真菌细胞膜的合成来发挥作用。每周使用1 - 2次即可，使用方便，但价格相对较高，一支可能在200 - 300元左右。不过它对于轻度到中度的灰指甲有一定疗效。环吡酮胺乳膏：局部涂抹后能渗透进入甲板，抑制真菌的生长繁殖。每天涂抹1 - 2次，连续使用数月。它的价格较为亲民，一支大概10 - 30元。不过使用时要注意避免接触眼睛和其他黏膜部位。
口服抗真菌药
伊曲康唑胶囊：它是一种脂溶性药物，需要与餐同服以促进吸收。采用冲击疗法，即冲击治疗期间每日2次，每次200mg，连服7日为一个疗程。停药3周后开始第二个疗程，一般需要2 - 3个疗程。不过在使用前需要检查肝功能，因为它可能会对肝脏有一定影响。特比萘芬片：口服后能迅速吸收，分布于皮肤角质层，从而发挥抗真菌作用。成人每次250mg，每日1次，疗程一般为6 - 12周。同样，使用前也需要关注肝功能情况，孕妇和哺乳期妇女要慎用。
综合治疗及注意事项
如果灰指甲病情较轻，外用药物可能是一个选择，但要坚持使用。如果病情较重，口服药物效果可能更好，但要在医生的指导下进行，因为口服抗真菌药有一定的副作用风险，需要监测肝肾功能等指标。另外，在治疗灰指甲的过程中，要注意保持足部的清洁干燥，穿透气性好的鞋子，避免与他人共用拖鞋、脚盆等物品，防止交叉感染。同时，要耐心治疗，因为灰指甲的生长周期较长，新的指甲长出需要一定时间，一般手指甲需要3 - 6个月，脚趾甲可能需要6 - 12个月甚至更长时间才能完全替换。