真菌感染的症状因感染部位不同而有所差异。比如皮肤真菌感染，常见的体癣会出现环形红斑，边缘有丘疹、水疱，伴有瘙痒，大约有30% - 50%的体癣患者会有明显瘙痒症状。
皮肤真菌感染症状
体癣表现： 初期是红色丘疹或小水疱，逐渐向周围扩大成环形，边界清楚，炎症明显，边缘有活动性丘疹、水疱和鳞屑。手足癣表现： 手足癣分为水疱型、鳞屑角化型和浸渍糜烂型。水疱型多发生在手指间、掌心等部位，出现深在性小水疱；鳞屑角化型表现为皮肤干燥、脱屑、粗糙增厚；浸渍糜烂型常见于指（趾）间，皮肤浸渍发白，去除白皮后为潮红糜烂面。
浅部真菌感染症状
头癣症状： 头癣在儿童中较为常见，白癣表现为头皮出现圆形或椭圆形灰白色鳞屑斑，病发失去光泽，常在距头皮0.2 - 0.8厘米处折断；黄癣会有典型的碟形黄癣痂，有鼠臭味，病发干枯、无光泽，严重时可导致永久性脱发。甲真菌病症状： 甲真菌病俗称灰指甲，表现为甲板浑浊、增厚、表面凹凸不平、变脆易碎，甲床与甲板分离，甲板变色，常见颜色有灰白色、黄色等。
深部真菌感染症状
肺部真菌感染症状： 肺部真菌感染可出现咳嗽、咳痰，痰液可为白色黏液痰或脓性痰，部分患者有发热，体温可在38℃左右，严重者会有呼吸困难等症状。消化道真菌感染症状： 消化道真菌感染时，患者可能出现吞咽困难、恶心、呕吐、腹痛、腹泻等症状，腹泻可为稀水样便或黏液便，严重者会导致营养不良等情况。