肝内钙化灶主要是肝细胞损伤后钙质沉积形成的影像学改变，而肝内胆管结石是肝内胆管中有结石。具体如下：
一、两者差异：
1.形成原因不同：肝内钙化灶多因肝脏一些病变如炎症反应、肝结核、原有肝脏良性或恶性肿瘤退缩坏死等致局部钙质沉积形成，不在胆管内；肝内胆管结石则是胆管内的结石，多数继发于胆囊结石，由胆道感染、寄生虫梗阻、先天性发育畸形等因素导致，与胆道相通且在胆管内。
2.临床症状不同：肝内钙化灶一般为良性病变，多数无明显临床症状，常在体检中发现；肝内胆管结石可引起发热、腹痛、黄疸、肝功能损害等症状。
二、鉴别方法：可选择腹部B超、腹部CT及磁共振等检查。肝内胆管结石在肝内呈现点状、斑点状、条索状或团块状强回声，沿肝内胆管走行分布，边界不规则，后方常伴声影，肝内某一段或某一叶多处损害，常为肝左叶受累；肝内钙化灶强回声病变可出现在肝实质任何部位，与肝内胆管走行不一致，可伴有声影，周边肝组织正常，多发生于肝右叶。
三、治疗方式：肝内钙化灶一般不会自行消退也不会继续发展，多数患者无需治疗，定期复查腹部B超观察即可；肝内胆管结石主要以手术治疗为主。
总之，肝内钙化灶和肝内胆管结石在形成原因、症状表现、鉴别方法和治疗方式上都存在差异，应准确区分并采取合适的处理措施。