巨细胞病毒感染后，不同人群症状有所不同。对于免疫功能正常的人，多数人感染时无明显症状，部分人可能出现类似感冒的表现，如发热（体温可在38℃左右）、乏力、咽痛等，持续1 - 3周可自行缓解。但对于免疫功能低下者，比如艾滋病患者、器官移植后服用免疫抑制剂的人，症状就会严重很多，可能出现肺炎，表现为咳嗽、气促；还可能有肝炎，出现黄疸、肝区不适等症状。
先天性巨细胞病毒感染症状
宫内感染： 约10%受感染的胎儿会出现先天性巨细胞病毒感染，可能导致胎儿生长受限，出生后体重低于正常胎儿；还可能出现小头畸形、脉络膜视网膜炎等，影响孩子的神经系统发育和视力。出生时感染： 部分新生儿出生时感染巨细胞病毒，可能有低体重、肝脾肿大、皮肤瘀点等表现，严重的可能出现血小板减少性紫癜。
后天获得性巨细胞病毒感染症状
儿童及青少年： 多数为隐性感染，也就是没有明显症状。但少数人会出现传染性单核细胞增多症样表现，有发热、咽痛、淋巴结肿大、肝脾肿大等，不过症状一般比典型的传染性单核细胞增多症轻。成人： 免疫功能正常的成人感染后，除了可能有类似感冒的症状外，还可能出现肺炎，表现为咳嗽、咳痰、呼吸困难等，不过相对少见。如果是免疫抑制状态的成人感染，比如器官移植患者，感染后可能引发严重的巨细胞病毒性肺炎，危及生命；也可能导致胃肠道受累，出现腹痛、腹泻等症状。
巨细胞病毒感染的其他表现
眼部感染： 无论是先天性感染还是后天免疫低下人群感染，都可能累及眼部，引起视网膜脉络膜炎，影响视力，严重时可导致失明。神经系统影响： 对于先天性巨细胞病毒感染的儿童，即使出生时没有明显症状，也可能在生长发育过程中出现神经系统后遗症，如智力低下、运动障碍、癫痫等。