腺样囊性癌的病因目前尚未完全明确，但有一些相关因素被认为可能与之有关。目前并没有确切的单一因素能完全解释其发病原因，但研究发现以下几方面可能有影响。
遗传因素相关
部分基因变异： 有研究表明，某些特定基因的变异可能与腺样囊性癌的发生存在关联。例如，一些涉及细胞生长、分化和凋亡调控的基因发生突变或异常表达时，可能会增加患腺样囊性癌的风险。不过，具体是哪些基因以及如何通过基因变异引发腺样囊性癌，还需要进一步深入研究来明确。
环境因素影响
长期接触某些化学物质： 长期接触一些具有致癌性的化学物质可能是诱因之一。比如，长期处于含有某些工业化学污染物的环境中，像某些有机溶剂等，可能会对人体细胞的遗传物质等产生影响，进而增加患腺样囊性癌的可能性。但目前关于具体哪种化学物质与腺样囊性癌的确切关联以及作用机制还在探索中。辐射暴露： 长期受到电离辐射暴露也可能与腺样囊性癌的发生有一定关系。例如，接受过头颈部放疗的人群，在放疗后的若干年里，患腺样囊性癌等肿瘤的风险可能会有所升高。不过，辐射导致腺样囊性癌的具体路径还需要更精准的研究来阐明。
细胞自身异常变化
细胞增殖和凋亡失衡： 正常细胞的增殖和凋亡处于动态平衡状态，当这种平衡被打破时，细胞可能会异常增殖。在腺样囊性癌的发生过程中，可能存在细胞增殖过度而凋亡受到抑制的情况，使得异常的细胞不断累积，从而形成肿瘤。具体的细胞内信号通路等调控机制还需要大量的基础研究去揭示。上皮细胞异常分化： 上皮细胞的正常分化对于维持组织器官的正常功能至关重要。如果上皮细胞出现异常分化，朝着恶性转化的方向发展，就可能逐渐形成腺样囊性癌。但目前对于上皮细胞异常分化导致腺样囊性癌的具体分子机制等还不是十分清楚。