灰指甲内服常用药物主要有伊曲康唑和特比萘芬等。一般来说，伊曲康唑采用冲击疗法，一个疗程通常需要服用数月时间；特比萘芬相对疗程较短，一般连续服用数月左右。
伊曲康唑：
作用机制： 伊曲康唑是一种合成的三氮唑衍生物，可抑制真菌细胞色素P450酶，从而影响真菌细胞膜麦角固醇的合成，发挥抗真菌作用。适用情况： 适用于皮肤癣菌和酵母菌引起的灰指甲，对多种致病真菌有抑制效果。特殊人群提示： 肝功能不全者需谨慎使用，使用前应检查肝功能，用药过程中也要定期监测肝功能。
特比萘芬：
作用机制： 特比萘芬能特异性地抑制真菌角鲨烯环氧化酶，使真菌细胞膜形成过程中角鲨烯堆积，导致真菌细胞死亡。适用情况： 对皮肤癣菌所致的灰指甲疗效较好，对酵母菌也有一定作用。特殊人群提示： 孕妇及哺乳期妇女慎用，因为其对胎儿和婴儿的影响还不明确。
氟康唑：
作用机制： 氟康唑可高度选择性干扰真菌的细胞色素P-450的活性，从而抑制真菌细胞膜上麦角固醇的生物合成。适用情况： 对于部分灰指甲患者也可使用，但相对伊曲康唑和特比萘芬，其抗真菌谱和疗效特点略有不同，一般用于较严重或对其他药物疗效不佳的情况。特殊人群提示： 儿童使用需谨慎，应在医生指导下权衡利弊后使用，因为儿童的肝肾功能发育尚未完全成熟，药物代谢可能与成人不同。