咽拭子常用于呼吸系统感染性疾病的检查，当出现发热、咳嗽、咽痛等症状且需明确病原体时，常做咽拭子检查以明确患者咽喉部是否有细菌、真菌或病毒等微生物感染，还能明确微生物种类以指导用药。常见疾病如扁桃体炎、感染新型冠状病毒、急性咽喉炎等。
一、扁桃体炎：这是常见的上呼吸道感染性疾病，通常因腭扁桃体感染而导致红肿、出血、咽部异物感等症状，通过咽拭子可明确是否存在扁桃体感染以及致病菌种类，进而使用敏感药物进行治疗。
二、感染新型冠状病毒：其主要侵袭呼吸道且以呼吸道传播为主，咽部病毒相对较多，咽拭子是检查新冠病毒较为简单快速的方法，可初步明确是否感染新冠病毒。
三、急性咽喉炎：由病毒、细菌侵袭引起，会出现咽喉黏膜弥漫性充血、肿胀，咽部细菌多来自外界，咽拭子细菌培养能有效明确致病菌，并依此选择敏感抗生素。咽拭子还可用于百日咳、白喉等多种呼吸系统疾病的检查。检查方法主要是用压舌板压下舌头，用干净棉签蘸取咽喉部分泌物进行检查，部分患者检查时会有轻微不适如恶心、呕吐，建议患者检查前两小时勿进食以防反流或误吸。
总之，咽拭子在呼吸系统感染性疾病的诊断中具有重要作用，可帮助确定具体病因和指导治疗方案。