射精时输精管部位疼痛可能是由于性生活过频、炎症、梗阻性疾病、腹股沟疝术后等原因引起。
一、性生活过频：男性如果平时性生活过于放纵，频率过高，就有可能导致在射精时出现疼痛。这种情况下，通常在合理调整性生活频率后，症状能够有所缓解。
二、炎症：
1.慢性前列腺炎：炎症刺激可导致射精疼痛。
2.精索炎：会引发相关部位的不适和疼痛，包括射精时。
3.输精管炎：其炎症反应会在射精过程中体现为疼痛。
三、梗阻性疾病：
1.输精管梗阻：使精液排出不畅，引起射精疼痛。
2.射精管梗阻：阻碍了正常的射精过程，进而产生疼痛。
3.精囊结石：结石的存在影响射精，导致疼痛发生。
四、腹股沟疝术后：部分腹股沟疝患者在接受网片修补术后，可能出现输精管扭曲、受压的情况，从而致使射精时疼痛。
当男性出现射精时输精管部位疼痛的状况时，应尽快就医，在医生的辅助下完善相关检查，以明确病因，并积极开展治疗。
总之，对于射精时输精管疼痛这种情况，要重视其可能的原因，及时进行诊断和处理。